利用草甘膦防治菟丝子的原理，主要是利用寄生与寄主两种植物对草甘膦耐药性的不同，即大豆对草甘膦有较强的耐药性，能忍受一定计量范围的药液浓度，而菟丝子的耐药能力却很差。方法是在菟丝子出苗后不久，危害大豆的初期，田间点片发生期。发现有菟丝子发病中心时，用10%草甘膦400倍稀释液喷洒在发病中心的大豆植株上，喷药要均匀，不要漏喷。喷药后10-15天，菟丝子大量死亡。但药后3-4天时，大豆的幼叶开始黄化，即有轻微药害表现，但对其生长发育没有大的影响，约7天后黄化株率停止扩展，10天左右幼叶全部变绿，恢复正常生长。另外，还要注意的是，由于菟丝子在田间不断发生，所以应在首次用药后的两周左右，要再查治1次，以达到彻底防治的目的。